在使用通風柜的時候需要注意以下幾點:
實驗人員在使用通風柜的時候不得將頭部伸進通風柜內,是實驗的過程中盡量降低調節門的高度,實驗過程中、完成后通風櫥門不要拉得過高。在通風柜內的裝備或其它設備總面積不得超過臺面板面積的50%。
當通風柜內開始產生污染物質時,操作人員必須慢慢地接近或離開通風柜。因為快速的移動將會造成靠近通風柜前開口處的氣流擾動,而帶出柜內的污染物質。

通風櫥內不可存放或實驗易燃易爆物品。
風柜使用前,檢查電源、給排水、燃氣等開關和管道是否正常;打開照明設備,打開排氣扇,檢查是否正常運行。
通風柜關閉前,排氣扇要繼續運轉幾分鐘,使柜內的廢氣徹底排除。
通風柜也要定期的維護保養,確保需要使用的時候可以正常工作。